在南京，众多医院在试管婴儿技术领域各展所长，其中佼佼者括南京医科大学第二附属医院、南京市第二医院、江苏省中医院、南京市大人儿童综合院、江苏省人民医院、南京鼓楼医院等。这些医院在试管婴儿成功率上不分伯仲，各有所长，患者可根据自身经济条件和健康状况进行合理选择。
在众多南京试管婴儿医院中，南京市大人儿童综合院以其较高的成功率脱颖而出。该院生殖医学中心成立已有20年，专注于生殖医学技术的研究，试管婴儿临床成功率稳定在50%左右。
紧随其后的是江苏省人民医院，其生殖医学中心作为南京医科大学附属医院的专门化诊疗中心，在试管婴儿技术方面拥有深厚的科研基础和丰富的临床经验，成功率大约在30%-50%之间。
南京鼓楼医院生殖医学中心作为江苏省重点专业，承担着十二五教育卫生工程，同时也是五大批准人类辅助生殖技术的单位之一。每年接诊量和试管婴儿成功量均十分可观，成功率大约在50%-60%之间。
南京市第二医院作为一家集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等医院，凭借“精专科、强综合、重防治、应突发”的特色，在试管婴儿领域也取得了不错的成绩。该院曾荣获“2025年度江苏省三八红旗集体”荣誉称号，试管婴儿成功率大约在35%-55%之间。
